Portugal tem vindo a aplicar diferentes programas de erradicação e vigilância de doenças dos animais bem como ações de controlo para a prevenção das doenças constantes do Programa Nacional de Saúde Animal (PNSA), designadamente em bovinos, ovinos e caprinos, tendo como objetivo a classificação de explorações e de áreas indemnes de doenças.

O Médico Veterinário Coordenador elabora anualmente o Programa Sanitário Anual,  detalhando as intervenções sanitárias a executar nas explorações, que têm por base o rastreio sistemático e periódico dos animais presentes nas explorações.